Linnugripp ja Newcastle`i haigus
Haiguste tutvustused:
ANALÜÜSIMEETODID
Tekitaja uuringud |
Meetod |
Uurimismaterjal |
Metoodika |
Osakond |
Lindude gripi viiruse (M, H5, H7 ja/või N1 geenide) määramine |
Real-time RT-PCR |
|
5MA-TJ-63 |
Molekulaaranalüüs |
Lindude gripi, sigade gripi ja hobuste gripi M geeni määramine |
5MA-TJ-67* |
|||
Lindude gripi viiruse N8 geeni määramine |
5MA-TJ-71* |
|||
Lindude gripi viiruse N6 geeni määramine |
5MA-TJ-89* |
|||
Lindude paramüksoviirus-1 (APMV-1) ehk Newcastle haiguse viiruse L geeni määramine |
|
5MA-TJ-3 |
||
Lindude Newcastle viiruse patotüpiseerimine |
Konventsionaalne RT-PCR ja sekventsanalüüs |
|
5MA-TJ-10* |
|
Lindude gripi viiruse patotüpiseerimine |
|
5MA-TJ-12* |
||
Newcastle haiguse viiruse isoleerimine ning identifitseerimine |
Viiruse isoleerimine (VI) ja identifitseerimine |
|
5DV-TJ69 |
Viroloogia-seroloogia
|
Lindude gripi viiruse isoleerimine ning identifitseerimine |
5DV-TJ-70 |
* meetod akrediteerimata
Antikeha uuringud |
Meetod |
Uurimismaterjal |
Metoodika |
Osakond |
Lindude gripi viiruse vastaste antikehade määramine |
Hemaglutinatsiooni inhibitsiooni (HAI) testiga |
|
5DV- TJ65 |
Viroloogia-seroloogia
|
Lindude gripi viiruse vastaste antikehade määramise |
ELISA |
5DV- TJ66 |
||
Newcastle ´i haiguse viiruse vastaste antikehade määramine |
HAI |
5DV- TJ67 |
||
Newcastle ´i haiguse viiruse vastaste antikehade määramine |
ELISA |
5DV- TJ68 |
Analüüsimeetod viiruse tuvastamiseks (VI ja/või PCR) valitakse sõltuvalt uuringu eesmärgist. Haiguskahtluse ja/või ebaselge uurimistulemuse puhul teostatakse alati ka viiruse tuvastamise teise analüüsimeetodiga.
ANALÜÜSE TEOSTAV LABORATOORIUM
Kreutzwaldi 30, Tartu
PROOVIDE VÕTMINE, SÄILITAMINE JA SAATMINE
Proovide võtmine teostatakse võimalikult puhtalt.
Surmajärgselt võetavad proovid
- Trahhea tampooniproov, kloaagi tampooniproov
- Organproovid: ajukude, trahhea, kops, põrn, maks ja seedetrakt.
Elupuhuselt võetavad proovid
- Igalt uuritavalt linnult võetakse proov steriilse tampooniga ja pannakse katsutisse.
- Koondada võib viie linnu tampooniproovid ühte katsutisse.
- Trahhea tampooniproov, kloaagi tampooniproov või roojaproov.
- Tampooniproovid võtta steriilse tampooniga, panna katsutisse.
Proovivõtu tampoone väljastab LABRISe Tartu labor.
Proovide pakkimine
- Iga linnu proovid pakkida eraldi puhtasse taarasse (nt plastkott, võimalusel kasutada soonsulguriga (minigrip) või traadiga suletavat plastkotti).
- Sooled ja seedetrakti sisu pakkida eraldi taarasse, et välistada nende kokkupuudet siseorganitega.
- Proov pakitakse lekkekindlalt. Eriti oluline on, et väline pakkematerjal on saastumata ning puhas.
- Iga pakend märgistatakse loetavalt.
Proovide laborisse saatmine ja säilitamine
- Organproovid ja korjused toimetatakse laborisse lühima võimaliku aja jooksul. Kui proovide kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse proove +4…+6 °C juures maksimaalselt 2 päeva või pikemaajaliselt -20 °C juures.
- Tampooniproovid toimetatakse laborisse lühima võimaliku aja jooksul. Kui proovide kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse proove +4…+6 °C juures.
Kaaskiri ja laboratooriumi teavitamine
- Koos proovidega saadetakse laborisse korrektselt täidetud ja piisavalt infot sisaldav kaaskiri, mille leiab LABRISe kodulehelt tellimuste vormid alt. Oluline on märkida kaaskirjale proovi võtmise täpne kuupäev ja kellaaeg.
ANALÜÜSI TEOSTAMISE AEG
Real-time RT-PCR: kuni 5 tööpäeva
Konventsionaalne RT-PCR ja sekventsanalüüs: kuni 10 tööpäeva
VI ja identifitseerimine: kuni 21 päeva
HAI: kuni 14 tööpäeva
ELISA: kuni 5 tööpäeva
Epideemia puhangu tingimustes võivad analüüside teostamise ajad pikeneda.
ANALÜÜSIMEETODID
Real-time RT-PCR: reaalaja pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon
Konventsionaalne RT- PCR ja sekventsanalüüs: konventsionaalne pöördtranskriptsiooni polümeraasi ahelreaktsioon ja sekventsanalüüs
VI ja identifitseerimine: viiruse isoleerimine ja identifitseerimine
ELISA: ensüüm-immuunsorbtsiooni meetod
HAI: hemaglutinatsiooni inhibitsiooni test
TÄIENDAV INFO JA KONTAKTID
• Viroloogia-seroloogia osakond. Info telefonil 738 6111 või 50 66 687
• Molekulaaranalüüsi osakond. Info telefoni 738 6121
Koostatud: 18.12.2019
Koostanud: Triin Tedersoo