Mareki haigus
Haiguse tutvustus:
ANALÜÜSIMEETODID
Analüüs |
Meetod |
Metoodika |
Osakond |
Mareki haiguse viiruse DNA tuvastamine |
Real-time PCR |
5MA-TJ-88* |
Molekulaaranalüüs |
* meetod akrediteerimata
Analüüsid viiruste täpsemaks iseloomustamiseks
Analüüs |
Meetod |
Metoodika |
Osakond |
Mareki haiguse viiruse genoomi iseloomustamine |
Sekveneerimine |
5MA-TJ-88* |
Molekulaaranalüüs |
* meetod akrediteerimata
Täiendav sekventsanalüüs teostatakse vajadusel isoleeritud/tuvastatud viiruse täpsemaks geneetiliseks iseloomustamiseks (s.h vaktsiini või virulentse tüve eristamine) ning epidemioloogia selgitamiseks.
ANALÜÜSE TEOSTAV LABORATOORIUM
Kreutzwaldi 30, Tartu
PROOVIDE VÕTMINE, SÄILITAMINE JA SAATMINE
Surmajärgselt võetavad proovid
Hiljuti surnud või hukatud lind tervikuna, suled (vähemalt 5 tk värskelt tõmmatud kontuur- või lennusuled) või kasvajate olemasolul kasvaja kude. Eelmiste puudumisel on sobivaks alternatiiviks põrn.
Elupuhuselt võetavad proovid
Suled (vähemalt 5 tk värskelt tõmmatud kontuur- või lennusuled).
Proovide pakkimine
- Iga linnu proovid pakkida eraldi puhtasse taarasse (nt plastkott, võimalusel kasutada soonsulguriga (minigrip) või traadiga suletavat plastkotti), sulgeda korralikult ning markeerida.
- Põrna ja kasvajate proovid pakkida eraldi taarasse, et välistada nende kokkupuude siseorganitega.
Proovide märgistamine ja kaaskiri
Proovid märgistatakse selgelt ja üheselt mõistetavalt. Koos proovidega saadetakse laborisse korrektselt täidetud ja piisavalt infot sisaldav tellimuste vorm, mille leiab LABRISe kodulehelt kaaskirjade alt.
Proovide laborisse saatmine
- Suleproovid toimetatakse laborisse 4-6 tunni jooksul. Kui kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse suleproove +4…+6 °C juures ning transporditakse need laborisse 24 tunni jooksul.
- Organ- ja kasvajaproovid ning korjused toimetatakse laborisse 4-6 tunni jooksul. Kui kohene transport ei ole võimalik, siis säilitatakse organproove +4…+6 °C juures või külmutatakse -20 °C juures ning transporditakse need laborisse 24 tunni jooksul.
ANALÜÜSI TEOSTAMISE AEG
Konventsionaalne PCR: kuni 5 tööpäeva
Genotüpiseerimine sekveneerimise teel: kuni 2 nädalat
ANALÜÜSIMEETODID
Konventsionaalne PCR (polümeraasi ahelreaktsioon).
Vajadusel täiendava analüüsina genotüpiseerimine sekveneerimise teel.
TÄIENDAV INFO JA KONTAKTID
- Molekulaaranalüüsi osakond. Info telefoni 738 6121
- Viroloogia-seroloogia osakond. Info telefonil 738 6111
Koostatud: 30.09.2020
Koostanud: Triin Tedersoo